臺州市農業科學研究院（簡稱臺州市農科院）屬綜合性農業科研機構，院本部現有職工58人，其中科技人員42人（高、中級科技人員34人）。設有作物研究所、生態環境研究所、園藝研究所、生物技術研究所、農產品質量檢測中心，以及為科研和生產、生活服務的院辦公室、科研管理處、計財處等八個職能處室。改革開放30年來，共獲得各類科研成果105項，其中獲各級政府（部門）獎勵96項，內有國家科技進步一等獎1項、三等獎2項，省（部）科技進步一等獎7項、二等獎17項等。“七五”以來各項科研成果累計推廣面積14830.4萬畝，創社會經濟效益73.18億元。
科研宗旨：全面貫徹“科教興市”的發展戰略，為農業增效，為農業增效、農民增收提供技術服務，為我市“358綠色行動計劃”、農業產業結構調整和率先基本實現農業、農村現代化提供強有力的技術支撐。
科研領域：糧油作物新品種的選育、引進與開發；蔬菜、瓜果作物新品種的選育、引進與開發；花卉及園林綠化苗木的供應和工程設計；生物工程技術；農產品的與生產；農業項目的測試與分析等。
臺州市農科院將按照“三個代表”的要求，立足臺州，面向全省，緊緊圍繞臺州市農業和農村現代化建設綱要和農產品生產計劃，堅持以服務“三農”為已任，以應用性、開發性、特色性研究為主體，注重品牌農業、外向型農業和標準化生產的研究，推進農業產業化進程，堅持以制度創新和技術創新為動力，積極探索科技體制改革路子，建立適應社會主義市場經濟規律和農業科技發展規律的運行機制；堅持以市場需求為導向，以科技成果求發展，以科技開展增活力，使之成為區域性農業研究開發中心。積極引進和努力培養現代農業科技人力，使之成為區域性農業研究開發中心。積極引進和努力培養現代農業科技人才，特別是學科帶頭人和懂管理、善經營的復合型人才的培養。加強與國內外大專院院校，科研單位的合作與交流。著重解決制約我市農業生產發展的重大關鍵性科學技術問題，做好科技成果的推廣、轉化和應用工作，提高我市農業科技進步貢獻率。為農業增效、農民增收服務，為我市率先實現農業、農村現代化提供強有力的科技支撐。
通過若干年努力，把市農科院建設成為具有科研、開發、推廣、培訓多種功能，且以基礎性、應用性為主兼有經營性、服務性多元發展。多種體制的農業科研機構，成為我市農業科技的依托和推進農業科技進步的龍頭。